"Trinity Universe" incorpora elementos de vários jogos de diferentes produtoras em um grande e exótico RPG japonês, recheado de referências ao gênero e a cultura pop nipônica, com piadas envolvendo videogames, sushi e desenhos animados. Por baixo do tom leve e cômico, o jogo apresenta mecânicas de exploração, batalhas por turnos e evolução de personagens e equipamentos. O universo de "Trinity" reúne personagens das franquias "Disgaea". "Atelier Iris" e "Spectral Souls", das produtoras NIS, Idea Factory e Gust, respectivamente, e dá ao jogador a opção de escolher entre dois personagens principais: o Demon Dog King Kanata e a Valkirie Rizelea. Os dois heróis e seus grupos se encontram diversas vezes durante o desenrolar da aventura, ambientada no Netheruniverse, uma coleção de planetas, idéias e itens descartados das três franquias que compõem "Trinity". O foco do game está na exploração de masmorras e na evolução dos personagens. As cidades são representadas com cenários simples e navegação rápida através de menus. Já as masmorras são cenários 3D bem detalhados, cheios de tesouros e salas para vasculhar. Ao pressionar um botão, o jogador é informado da localização dos pontos de interesse, como tesouros e monstros importantes. Essa magia de busca está disponível em quantidade limitada e não é possível se mover quando a magia é ativada, apenas observar as marcações antes de sair em busca de recompensas ou desafios.